在杞麓湖污染治理过程中，除了领导干部政绩观扭曲、决策任性、专家在项目评审中丧失原则立场等问题外，个别公职人员与一些商人、老板之间存在不正当交往和不正常的利益往来，严重违纪违法问题逐渐浮出水面。
杞麓湖治理中的弄虚作假、水质长期得不到改善问题，并非简单的投机造假行为，而是一些党员干部、商人老板、专家、掮客等，围绕一个“利”字，以利益为纽带，以潜规则为链条，形成利益团伙，他们彼此相互掩护，权力、金钱、技术之间相互渗透，把魔爪伸向国有资金和重大项目，致使“杞麓湖之痛、杞麓湖之殇”。
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